PCR und short-tandem-repeat?

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Dansa
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Veröffentlicht am Samstag, den 27. April, 2002 - 16:48:   Beitrag editierenBeitrag drucken

Hallo!

Eine Frage hätte ich da noch*g*:

Warum nimmt man bei der PCR- Methode die STR Gene? Ich weiß, dass die keine Funktion haben und dass sie halt diese sich immer wiederholenden Einheiten haben.
Aber warum nimmt man gerade diese?

Dansa
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nadine82
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Veröffentlicht am Samstag, den 27. April, 2002 - 19:59:   Beitrag editierenBeitrag drucken

hi dansa. hab vor 2 wochen mein abi geschrieben und da kam auch etwas über die PCR-methode dran, aber nichts von STR genen. was soll das denn überhaupt sein? wäre jetzt echtmal interessant.
bye nadine
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Flohbus
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Veröffentlicht am Sonntag, den 28. April, 2002 - 00:02:   Beitrag editierenBeitrag drucken

Guten Abend Dansa! Die STR's sind keine Gene, sondern wie der Name sagt: Kurze hintereinanderliegende Sequenzwiederholungen, sorry. Die findet man an den verschiedensten Stellen im Genom. Warum man die so gerne als Beispiel verwendet? Nun, prinizpiell istÕ}A
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Flohbus
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Veröffentlicht am Sonntag, den 28. April, 2002 - 00:03:   Beitrag editierenBeitrag drucken

Guten Abend Dansa! Die STR's sind keine Gene, sondern wie der Name sagt: Kurze hintereinanderliegende Sequenzwiederholungen, sorry. Die findet man an den verschiedensten Stellen im Genom. Warum man die so gerne als Beispiel verwendet? Nun, prinizpiell ist ihre Zahl und Größe nicht festgelegt. So sind sie also von Individuum zu Individuum verschieden und können bspw. für die Identifizierung einer Person verwendet werden. Krimi's lassen grüßen. ;-) Nun, eigentlich egal. PCR (Polymerase Chain Reaction - Polymerase Kettenreaktion) hat eigentlich nicht wirklich etwas damit zu tun. Es ist einfach generell ein Verfahren zur gezielten Anreicherung von beliebugen Nukleinsäuremolekülen (meistens DNA, hat man RNA dann wird eine sogenannte RT-PCR gemacht) definierter Länge aus einem Gemisch von Nucleinsäuremolekülen. Hört sich sehr geschwollen an, ist aber eine sehr etablierte und weit verbreitete Technik mit vielen verschiedenen, speziellen Anwendungen.
Bemerkung: Primer sind in der PCR kurze einzelsträngige DNA-Moleküle, die sich an die "langen" "Vorlagen/Matritzen"-Moleküle, wenn diese auch einzelsträngig sind, anlagern können und dann verlängert werden.
PCR-Bild
Hoffe das hat Dir ein bisschen geholfen.
Gruß
Flohbus
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MiteMan
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Veröffentlicht am Montag, den 29. April, 2002 - 12:27:   Beitrag editierenBeitrag drucken

Hi Dansa,
ich möchte Flohbus dahingehend ergänzen, dass man mit STRs nicht nur Individuen charakterisieren / unterscheiden kann (denn das kann man auch mit anderen PCR-gestützten Systemen).
Viel wichtiger ist, dass die STRs (d.h. die DNA-Abschnitte, in denen eine bestimmte Sequenz, ein sog. Motiv, mehrmals wiederholt ist) nach den Mendelschen Regeln weitervererbt werden (codominant).
Das bedeutet, dass sich damit auch Abstammungsanalysen durchführen lassen, sei es im forensischen Bereich bei Vaterschaftstests, sei es im Bereich der Züchtung von Nutzpflanzen, um die tatsächlichen Elternsorten einer neuen Sorte zu ermitteln (was in der Praxis oft ansonsten gar nicht möglich ist, wenn Du Dir vorstellst, dass Du irgendwo sitzt, Miniaturstaubbeutel abschneidest und mit einem Pinselchen Pollen auf winzigkleine Narben rüberfummelst).

Gruß
MiteMan

P.S.: Wenn Du weitere Informationen dazu suchst, schau auch unter Microsatelliten oder ssr-Markern nach. Ist das selbe und entspringt nur der unbändigen Freude der Molekularbiologen an immer neuen, immer schlaueren Abkürzungen.
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Jule Stern (Julestern)
Neues Mitglied
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Veröffentlicht am Montag, den 29. April, 2002 - 19:48:   Beitrag editierenBeitrag drucken

Hallo Flohbus-danke, genau da hatte ich auch Schwierigkeiten!! Ist die TATA-Box dasselbe wie die Pribnow-Box?
:-( Ich verzweifle an Bio....
Gruß, JULE*
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Flohbus
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Veröffentlicht am Montag, den 29. April, 2002 - 21:44:   Beitrag editierenBeitrag drucken

He Julestern! Komm schon: "Steife Ohren!". So viele haben es gepackt, Du schaffst es auch. Immerhin stellst Du richtige Fragen, was bedeutet, dass Du weisst was Du nicht weisst. Das ist der richtige Weg um diesen Kram hier zu kapieren. :-) So aber jetzt zu Deiner Frage:
Fast richtig. ;-) Bei den Eukaryonten heißt die TATA-Box auch Hogness-Box. Sie ist analog (vergleichbar) zur -10-Region der Prokaryonten, die Pribnow-Schaler-Box genannt wird. Ok?!
Wie gesagt, keine Bange! Weiter fragen!
Gruß
Flohbus

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